在進行資料救援時，內接與外接硬碟的處理方式需因應其結構與工作環境而有所不同。內接硬碟透過SATA或M.2介面與主機板相連，傳輸速度快、電源穩定，適合進行深層磁碟掃描與完整映像備份。這類硬碟通常安裝在桌上型主機或伺服器中，操作環境穩定，問題多數源自硬體老化、韌體錯誤或系統崩潰導致的邏輯故障。
外接硬碟則透過USB或Type-C進行傳輸與供電，雖然方便攜帶與操作，但穩定性較低。尤其當使用筆電或USB延長線時，容易因供電不足導致硬碟無法啟動或反覆掉電。此外，外接硬碟因經常被插拔或移動，更容易因撞擊、靜電或潮濕環境造成磁頭偏移或控制板燒毀，使得資料救援的難度提升。
內接硬碟的處理建議使用穩定的桌機環境與專業救援工具先建立磁碟映像，再進行分析；外接硬碟若出現異常，應先檢查供電品質與線材是否穩定，若仍無法正常使用，可拆除外殼後改為SATA內接操作。針對不同硬碟結構擬定合適的處理步驟，是保護資料安全與提高救援成功率的關鍵。
當硬碟出現資料無法讀取、系統要求格式化或根本不被偵測時，實際上可能遇到的是邏輯性損毀或實體性損壞，兩者對資料救援難度與處理方式有明顯差異。邏輯性損毀屬於軟體層面錯誤，包含分割區錯亂、檔案系統損壞、MBR失效或誤刪除分割區等情況。此類損壞不會破壞硬體，硬碟仍能正常啟動且被作業系統識別。可透過專業救援工具執行磁區掃描與資料簽名比對，再重建檔案目錄與內容。若磁區未被覆寫，救援成功率高，過程快速且不具破壞性。
實體性損壞則屬於硬體層面的故障，例如磁頭碰撞碟片、碟面刮傷、馬達無法運作或PCB燒毀導致無法供電。這些情況常由摔落、潮濕或電壓不穩引起，表現為硬碟無法開機、無反應，甚至發出異常聲響。此類損壞需在無塵室進行拆解，更換受損零件後，以磁碟映像方式備份可存取區塊，再透過資料重建技術嘗試還原檔案。處理時間長、費用高，且受碟片受損程度影響甚鉅。
簡單判斷方式如：是否能被系統偵測、有無異音、電腦是否能讀取裝置，皆可作為判斷依據，幫助選擇正確的救援策略。
當硬碟發生故障或資料無法讀取時，許多企業與個人用戶會選擇專業的硬碟救援服務。台灣的硬碟救援服務價格依照損壞情況與處理技術的不同而有所變化。若為邏輯性損壞，例如檔案系統錯誤、格式化或檔案誤刪，修復過程通常較簡單，價格大多介於新台幣3,000至9,000元之間。相較之下，實體損壞如磁頭故障、碟片刮傷或電路板故障，則需要進行開盤並在無塵室內進行專業修復，費用通常從15,000元起，且根據硬碟型號與損壞程度有所不同。
許多專業硬碟救援廠商會提供免費的初步檢測，並在檢測後提供詳細的報價單。報價單會列出檢測費、開盤費、修復工時及資料轉存費等費用項目。雖然部分廠商宣稱「資料成功救回才收費」，但實際上仍可能在檢測或開盤過程中收取相應的基礎費用，使用者應在選擇服務廠商時，仔細了解所有條款與費用細節，避免隱性收費。
資料隱私與機密性保護是選擇硬碟救援服務時的關鍵考量，尤其是對於處理商業機密或敏感資料的企業用戶。專業廠商通常會設有封閉式作業區，並對作業人員的資料存取進行嚴格管理，保障資料不會被未經授權的人員接觸。對於涉及機密資料的客戶，廠商應提供作業紀錄、全程錄影監控與資料銷毀證明等額外保障措施，確保資料在處理過程中不會外洩或遭到未經授權的存取。
當硬碟在運行過程中發出異常聲音，如「咔嚓聲」、「嗡嗡聲」或「反覆點擊聲」，這些通常是硬碟物理性故障的徵兆。這些聲音通常意味著磁頭無法正確定位，或者碟片表面有損傷。這樣的問題會導致硬碟無法正常存取資料，並且若不加以處理，會迅速加劇資料損壞的情況。當發現異常聲音時，應立即停止使用硬碟並避免寫入新資料，從而減少資料進一步損壞的風險。
若硬碟顯示為RAW格式或容量顯示為0位元組，且系統提示「請格式化磁碟」，通常是檔案系統損壞的表現。這可能是由於分割表錯誤或檔案系統崩潰所引起，會使得硬碟無法正確掛載或讀取資料。在這種情況下，如果繼續進行格式化或修復操作，將會覆蓋原始資料結構，使資料無法恢復。因此，這類情況發生時應避免執行格式化，並停止操作。
此外，若硬碟的容量顯示異常，例如原本1TB的硬碟顯示為32MB，或者完全無法顯示容量，這可能是由於硬碟的韌體錯誤或磁區索引損壞所引起。即使資料仍在硬碟中，系統無法正確識別資料的存儲位置，會使資料的存取變得困難。此時，應立即停止所有操作，並避免進行寫入或格式化。
遇到這些警訊時，應立刻停止使用硬碟，並關閉電源。避免進一步的資料損壞。此時，建議使用只讀模式的工具建立硬碟映像，保護當前資料結構。然後，應將硬碟交由專業的資料救援機構進行處理，以最大程度地恢復資料。
當硬碟發生故障，無法啟動或無法讀取資料時，專業的資料救援會根據損壞情況分為幾個主要階段進行處理。第一階段是初步檢測，技術人員會使用韌體診斷工具、控制模擬器與扇區掃描儀來檢測硬碟的狀況。此階段能夠確認損壞的性質是邏輯錯誤（如分割區遺失、檔案系統錯誤）還是實體故障（如磁頭損壞、主軸卡死、PCB損壞）。所有操作都必須避免對硬碟進行寫入操作，以免對原始資料造成進一步損害。
若故障被確認為實體損壞，第二階段則進入無塵環境處理。在此階段，硬碟的拆解與修復作業需在Class 100等級的無塵室內進行，這樣能防止灰塵和靜電對硬碟造成損壞。無塵室內配備HEPA濾網、靜電釋放設備及恆溫濕度控制系統，確保操作環境的穩定與潔淨，並避免外部環境對硬碟內部的影響。
第三階段是開盤操作，這是資料救援流程中技術要求最高的部分。技術人員會使用顯微操作平台、磁頭更換工具與碟片固定夾具，精確地處理磁頭、轉軸或碟片等內部零部件的維修或更換。此階段需要極高的精密度和操作穩定性，任何細微的誤差都有可能對資料造成永久損壞。
第四階段是資料重建，技術人員會使用磁碟映像擷取工具建立硬碟影像，並利用資料結構重建軟體恢復丟失的檔案。這一階段需要強大的技術支持和高效的恢復工具，能夠將受損資料從損壞的硬碟中重建出來。